石河子機場2018年度共運輸旅客16.97萬人次，同比增長106.3%，貨郵104.1，同比增長-4.3%,保障起降2680架次，同比增長121.4%。2018年度累計放行1271班次，正常放行1191班次，放行正常率為93.71%，排名全疆機場第14位，同比提升5.53個百分點，天氣原因占不正常航班的45%。
石河子機場目前運營的航空公司有中國國航、深圳航空、南方航空、華夏航空、東方航空、烏魯木齊航空。運營的國內航線有石河子至北京、成都、鄭州;疆內航線有石河子至塔城、伊寧、庫爾勒、喀什、哈密。
