第21驅逐中隊很快被命令飛往甲米地海軍基地和科雷吉多要塞上空巡邏,他們未能參加后來克拉克機場上空的空戰。
伊巴機場的第3驅逐中隊在尼科爾斯機場沒有找到日本轟炸機,而是白白兜了一圈,耗盡了燃料。當第3驅逐中隊的戰斗機返航伊巴機場準備降落補充燃料時,日軍轟炸機開始空襲伊巴機場。
日軍投下炸彈之前,第3驅逐中隊燃油不足的戰斗機勇敢的對日軍發起了一次進攻,4架P-40立刻被日軍在空戰中擊落。還有一架在海面迫降。幸存的戰斗機前往林加延灣附近的羅薩萊斯機場降落。
注:據日軍三空零戰隊指揮官橫山保大尉回憶,日軍攻擊編隊當時在6000米高度飛行,他們看到這批十余架美軍戰斗機在4000米高度飛行,我之前提過的菲律賓遠東空軍氧氣罐數量不足,限制了美軍戰斗機飛行高度,他們不能駕駛P-40戰斗機在高空作戰。而失去高度優勢的美軍P-40戰斗機很難打出擅長的BZ——俯沖掠襲戰術。
日軍對伊巴機場的空襲摧毀了遠東空軍在呂宋島上唯一一部可用的SCR-270雷達(另一部在甲米地海軍基地的海軍陸戰隊手中),盟軍失去了雷達預警優勢。
13時35分,僅比日軍預計攻擊時間晚5分鐘,日軍飛抵克拉克機場,此時負責掩護的第17驅逐中隊的17架戰斗機在馬尼拉灣上空18000英尺巡邏,竟然沒有發現空襲克拉克機場的日軍機群。遠東空軍這唯一的一道防護也沒有起到應有的作用。
克拉克機場直到敵機凌空才發現,打出3發信號彈命令第20驅逐中隊緊急升空攔截日軍,只有第20驅逐中隊指揮官Joe Moore中校率領的3架P-40B戰斗機在日軍轟炸前成功從克拉克機場起飛,Joe Moore中校,Randall D. Keator中尉和Ediwn Gilmore中尉。
在空戰中,由Randall D. Keator中尉擊落一架零式戰斗機(臺南空飛行員廣瀨良雄(NAP3c Yoshio Hirose),確認戰績),而Joe Moore中校則是宣稱擊落了兩架零戰(未經確認),此外還有一架日本陸攻被擊落。
日軍轟炸機編隊對克拉克機場上沒有任何防護措施停放著的,正在加油的B-17空中堡壘和P-40戰斗機投下636枚60公斤炸彈。護航的臺南空戰斗機也沒閑著,新鄉英誠留下一個中隊戰斗機在高空掩護,另外3個中隊的零式戰斗機俯沖下來,對機場上的美軍飛機進行反復掃射。
除了Joe Moore中校的小隊,克拉克機場的第20驅逐中隊全軍覆沒,第19轟炸大隊的18架B-17轟炸機中的15架被炸毀在地面,在地勤人員的努力下后來修復了3架。

德爾卡門機場第34驅逐中隊的老式賽維斯基P-35A戰斗機,發動機上罩著顯眼的紅色防雨布
日軍忽視的德爾卡門機場,駐扎著裝備賽維斯基P-35A戰斗機的第34驅逐中隊,他們起飛飛往克拉克機場攔截轟炸后返航的日軍轟炸機,期間還有一些被打散的伊巴機場第3驅逐中隊的P-40戰斗機參戰,赫爾伯特.埃利斯(Herbert Ellis)中尉號稱擊落了3架日軍零戰,自身也損失了兩架。赫爾伯特中尉的P-40燃料耗盡后撞上克拉克機場附近的火山墜毀,他本人被救出。
日軍開戰首日的總損失為:
一架陸攻
臺南空零戰5機(中浦良一、河野安次郎、青木吉男、佐藤康久、廣瀨良雄)
三空零戰2機(伊藤文雄,吉井三郎)
美軍首日損失為:
P40戰斗機 共107機,損毀53機
(克拉克機場的第20驅逐中隊和伊巴機場的第3驅逐中隊損失過半)
B-17空中堡壘 共35機,損毀15機(后修復3機)
其他飛機 損毀30機
美軍主力P40戰斗機,B17空中堡壘首日損失過半!!

菲律賓空戰首日以日軍勝利告終,這個勝利建立在日軍以集中的優勢兵力對陣缺乏訓練和補給的美軍基礎上,一連串的巧合與美軍消極被動防守促成了日軍成功用炸彈將遠東空軍大部分戰機摧毀在機場地面。呂宋島北部地面部隊指揮官喬納森·W·賴特少將后來寫道。“那一天我才意識到,在沒有空軍的情況下,試圖打一場戰爭是徒勞的。"