2019年6月9日，日本方面報道日本政府基本決定中止旨在查明航空自衛隊墜毀的F-35A隱身戰斗機，在日本青森縣附近海域墜毀的搜尋工作。日本航空自衛隊在徹底采取安全管理措施后，在基于安全基礎上在近期恢復F-35A該型號戰斗機的飛行。

而就在日本航空自衛隊剛剛宣布停止搜索F-35A隱身戰斗機殘骸和打撈飛行員尸體的時候。日本方面爆料表示四月發生在北海道海域的F-35A 隱身戰斗機的墜機事故，日本海上自衛隊已經發現和打撈日方飛行員尸體的殘骸一部分，日本方面表從部分分散的水域發現, 有部分隨便尸體被認為是日本F-35A戰斗機駕駛員尸體的一部分。日本已經對飛機的搜尋工作已有效停止。

對此，日本國內對日本宣布F-35A隱身戰斗機發現遺體后，紛紛表示“細思極恐！這劇情已經了恐怖小說，怎么出現了碎尸的情況”，“日本航空自衛隊對這名飛行員到底做了啥？”。而結合之前美國、日本出動大軍對周邊進行聯合封鎖和搜索來件，美國多出B-52H戰略轟炸機在該海域出沒為的就是使用百枚深水炸彈將這架墜毀的F-35A隱身戰斗機炸毀，美日的意圖就是，在確定日本航空自衛隊F-35A隱身戰斗機飛行員已經無法生還的情況下，使用大型深水炸彈，將沉入海底的F-35A隱身戰斗機摧毀，保證F-35A隱身戰斗機的殘骸或者機體不被俄羅斯潛艇拿走。

對于美日的做法，特別是美國B-52H戰略轟炸機投百枚深水炸彈的做法，俄羅斯方面早就以監控到了：俄羅斯海參崴地震監控站就發現日本北海道附近就有出現4.0級地震，地緣深度為0.0，為人工地震。俄羅斯方面當時就認為這是美軍B-52H戰略轟炸機投放的深水炸彈所為。

而美國B-52H戰略轟炸機使用的深水炸彈直接將日本F-35A隱身戰斗機飛行員的遺體給炸了出來，并且日本飛行員遺體炸碎了，這才導致有遺體碎片漂了上了！雖然日本航空自衛隊打撈出了日本飛行員遺體，但是日方也沒有具體介紹這部分碎尸到底是這名飛行員身體哪個部分，也沒介紹日本F-35A隱身戰斗機有哪些地方被打撈了上來。

第五代日本戰斗機F-35A于4月9日在太平洋上空的三澤（青森縣）軍事基地以東135公里處從雷達上消失。飛機在空中飛行了28分鐘。日本方面表示控制戰斗機的飛行員有3200個飛行小時，其中只有60小時是在F-35A隱身戰斗機。墜毀的F-35A隱身戰斗機是日本在三菱重工業公司工廠組裝的第一臺F-35A，戰斗機于2017年7月12日首飛。

早前在搜索過程中，美日發現了發動機和戰斗機機翼的碎片。日本飛行員和大多數飛機都沒有找到。事故發生后，部署在青森縣三澤空軍基地的其余12架F-35A戰斗機的飛機被暫停。日本自衛隊消息人士所指出的那樣，根據其他三架F-35A戰斗機在墜毀附近飛行所獲得的數據，F-35A隱身戰斗機將能夠采取措施加強安全性。

日本消息人士稱，F-35A配備了在飛機之間交換飛行數據的系統，重建了事故現場。日本自衛隊還停止搜尋落入大海的F-35的殘骸。對于美日來說，一直將F-35隱身戰斗機視為自己的絕對保密“武器”，隨意這種戰機絕不能落入到了俄羅斯人的手里，炸毀飛行員遺體也在所不惜。​