投影室后面是指揮中心團隊區域，提供可供29名人員同時工作的工作區，每個座位上都配有自動數據處理設備，提供自動數據處理，自動交換機，電話和無線通訊裝備，監視器面板等。
主甲板末端的后艙是技術控制（技術控制）區域。該區域是所有通信和通信技術人員的神經中樞。
休息區占據主甲板位于飛機尾部的剩余部分，為機上工作人員提供休息和睡眠區。其余區域包含食物儲存，也用于宗教儀式。
在機頭入口區域后面是國家指揮局（NCA）區域，該區域是作為行政套房設計和布置的。它包含一間辦公室，一間休息室，一個睡眠區和一間更衣室。該領域的電話工具為NCA提供安全，清晰的全球通信。
2001年9月11日，五角大樓受到襲擊后，一架與E-4B被新聞媒體和平民發現在華盛頓特區的上空飛行。據事后披露，當時一架E-4B飛機正在參加演習，當第一架飛機撞擊世界貿易中心時，演習被取消。當時空中交通管制記錄和雷達數據顯示，這架呼號VENUS77的E-4B在上午9:44之前到達在白宮北面空域，然后又被追蹤飛到華盛頓特區的南部，在那里它持續盤旋。
